Калининградский рыболовный клуб


Расшифровку генома сёмги планируется завершить зимой


Простая, никому не известная сёмга по кличке Салли станет объектом пристального внимания на мировой рыбоводческой арене.

Первый образец генома сёмги — принадлежащий самке по кличке Салли — будет полностью расшифрован к концу 2013 года, и учёные со всего мира уже изучают возможности применения этого опорного генома для решения проблем, встающих при выращивании сёмги на рыбоводческих фермах.

«Имеются ожидания, что это привнесёт улучшения в аквакультуру, сделает её более узконаправленной и более стабильной, — объясняет Стейнар Бергсет, председатель Международного сотрудничества по расшифровке генома сёмги, советник норвежского Совета по науке. — Мы можем заглянуть в гены и понять, как на них влияют болезни, усвоение пищи, внешние воздействия и приспособление к среде обитания».

Расшифровка генома сёмги началась в 2009 году, когда норвежские, канадские и чилийские органы финансирования научных работ влили в проект миллионы долларов. Планировалось завершить расшифровку этой весной, но из-за сложности работ сроки потребовалось перенести.

«Геном не такой лёгкий в расшифровке», — отмечает Стейнар Бергсет.

Если у большинства организмов генетическая информация зашифрована в двух полинуклеотидных нитях ДНК, у сёмги генетический материал хранится в четырёх нитях — по двум от каждого родителя. И это весьма длинные нити, с повторяющимися участками, что осложняет учёным задачу разделить пучки ДНК на рабочие фрагменты, определить, какие нуклеотидные последовательности на них находятся и затем снова сшить их.

Как только эта работа будет выполнена, учёные узнают местонахождение отдельных последовательностей, а это первый шаг к выяснению их функции.

«Определение первичной структуры, понимание того, где находятся гены не обязательно означает, что вы узнаете функцию тех белков, которые они кодируют», — предупреждает Унни Гримхольт, научный сотрудник Центра экологического и эволюционного синтеза Университета г. Осло. Унни Гримхольт входила в коллектив учёных, в 2009 году расшифровавших геном трески.

«Мы не узнаем всего о сёмге только потому, что заглянем в её геном, — говорит она. — Это не конец путешествия, мы всё ещё на полпути».

Но уже такое продвижение — это шаг вперёд. Принимая во внимание значение разведения сёмги для норвежской экономики — а Норвегия является одним из ведущих производителей искусственно выращенной сёмги, в 2008 году норвежское производство составило треть мирового — Совет по науке Норвегии выделил почти 5,5 млн. евро на три проекта, в рамках которых расшифрованный геном будет использоваться для преодоления ряда специфических препятствий, встающих в области аквакультуры.

Один из таких проектов, возглавляемых Анной Трёдсон Варгелиус, научным сотрудником Института морских исследований (г. Берген), попытается локализовать гены, отвечающие за созревание и позднее взросление организма.

С точки зрения рыбной промышленности, рыба, позже достигающая полового созревания, предпочтительнее более «скороспелой» по той причине, что позднее созревание даёт шанс вырасти больше, говорит Анна Трёдсон Варгелиус.

В рыбном хозяйстве были попытки селекции рыбы, созревающей в более поздние сроки, но эта стратегия ушла из практики, как только было обнаружено, что половое созревание можно отсрочить, подвергая рыбу действию постоянного освещения. Но теперь половое созревание ускоряется в связи с повышением температуры воды, и постоянного света может оказаться недостаточно для его задержки. «Эта проблема проявляется всё заметнее», — рассказывает исследователь.

Учёные надеются выявить гены, ответственные за половое созревание, исследовав геномы в популяциях, в которых созревание происходит после одного года, и сравнив их с геномами в популяциях, где рыба созревает за три года или позже. Такое будет возможно, поскольку исследователи смогут воспользоваться расшифровываемым в настоящее время геномом в качестве шаблона.

Но задача при этом остаётся исключительно объёмной.

«Всё дело в том, чтобы суметь понять, какие из миллионов отличий как-то связаны с созреванием», — говорит Анна Трёдсон Варгелиус.

Когда эта задача будет выполнена, можно будет разработать чип, читающий маленький участок генома и позволяющий определить, имеются ли генетические последовательности, обусловливающие склонность к более позднему созреванию. Этой информацией смогут воспользоваться селекционеры при отборе.

Другие проекты, получившие финансирование, занимаются поиском генов, ответственных за сопротивляемость паразитам и за хорошую структуру мышечной ткани. Следующей весной многие из исследователей, занятых на этих проектах, присоединятся к Стейнару Бергсету и его коллегам — планируется поделиться находками на международной конференции.

Andrea Hill

"fishkamchatka.ru" 24.05.13 г.


главная журнал"СР" газета"РОГ" статьи форум карпомания фото спорт журнал"БР" охота


k®k 2002-2014 Рейтинг@Mail.ru Rambler's Top100